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新沂市中医医院内镜室位于医院门诊二楼内镜检查，现有主任医师1名、副主任医师1名，主治医师5名、副主任护师1名，主管护师3名，护师2名，科室技术力量雄厚。
科室设有两间胃镜室，一间肠镜室，单独的洗消间及储镜室，引进日本进口Olympus290及富士能胃肠镜、Olympus十二指肠镜、Olympus支气管镜数条，能开展常规的胃肠镜检查及各种镜下治疗，早癌筛查，幽门螺旋菌检查，可同时完成病变的影像记录及内镜下活检；并能熟练完成内镜下止血，异物的钳取，胃肠粘膜高频电刀切除术（EMR/ESD），内镜下食管，贲门狭窄的扩张及支架置入。对于不能耐受普通胃、肠镜检查的儿童、老年人、以及恐惧胃肠镜检查的人群，内镜室成功开展了无痛胃、肠镜检查。
内镜室按照国家卫生部颁布的《内镜消毒规范》配备有完善的消毒设备，严格按照消毒程序进行胃（肠）镜消毒。“以人为本，优质高效”是内镜室全体医务人员的服务宗旨。内镜室将以精湛的医术，热情周到的服务欢迎广大患者应诊。